Ces dernières années, l'Union douanière a été confrontée à toute une série de défis : une croissance exponentielle du commerce électronique (notamment les envois de faible valeur, principalement en provenance de Chine), des évolutions géopolitiques et un nombre croissant de mesures politiques sectorielles de l'UE que les autorités douanières doivent faire respecter. Combinés à un réseau fragmenté d’autorités douanières et à une diversité de systèmes informatiques, ainsi qu’à des procédures douanières de plus en plus complexes qui pèsent tant sur les entreprises que sur les autorités, ces défis exposent l’UE à divers risques, tels que la perte de recettes, la fraude et les activités criminelles, l’importation de produits dangereux sur le marché de l’UE et une compétitivité affaiblie par rapport aux entreprises non européennes.